PiVAT® 生物信息学分析平台
PiVAT® 生物信息学分析平台
PiVAT®(The Pillar Variant Analysis Toolkit)是智能化生物信息分析软件系统,全Web界面,一步完成从测序原始数据(bcl或fastq)到突变列表的全部分析工作。 与基于SLIMamp的NGS检测互相补充,可得到精准可靠的突变分析结果。PiVAT软件包可以部署在云端或本地,而且使用标准的FASTQ文件格式处理数据。
通过局部比对或者从头合成序列拼接可以检测到较长的indels,同时抑制了因富集和分析方法产生的错误。
PiVAT提供一个标准的BAM(Binary Alignment Map)文件,同时也提供了一个PBAM的PiVAT版本。两者在标准生物信息流程中可以互换使用。
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PiVAT 生信分析流程基因组比对
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PiVAT 通过减少测序错误为损坏的样品
提供了可靠的分析结果
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评估突变检测的精确性(样本数:10)
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普通重现误差率(Q值≥20)用橙色表示
经PiVAT分析后较低的误差率用绿色表示
PiVAT生分信析软件携手ampPD引物设计平台和SLIMamp专利建库技术
提供目标区域靶向检测NGS全流程解决方案