脑胶质瘤基因检测Panel
本panel基于SLIMamp®专利技术(专利号:ZL 2016 8 0001111.1),检测FFPE样本中脑胶质瘤相关IDH1/2、TERTp、BRAF基因的热点突变,以及染色体区段1p,19q,10q的部分MSI位点,分辨相应区段的大片段缺失;可以辅助临床诊断进行疾病的分子分型,为患者提供用药指导和预后预测。
Panel 优势
基于WHO和NCCN指南推荐,检测IDH1/2、TERT、BRAF和1p19q,辅助临床进行疾病分型
使用匹配的PiVAT分析软件完成数据分析,精准高效
建库时间短,仅需5小时即可完成文库构建,操作时间低至2小时
最低仅需20ng即可获得浓度和总量满足测序的文库
基因列表
检测基因 | 检测意义 |
1p19q | 诊断:患者存在1p19q联合缺失和IDH突变,提示为少突胶质细胞瘤 |
用药和预后:1p19q联合缺失阳性患者预后良好,且对烷化剂、放化疗敏感 | |
IDH1 | 诊断:IDH突变提示肿瘤为Ⅱ/Ⅲ级星形细胞瘤或少突胶质细胞瘤或继发性胶质母细胞瘤 用药和预后:①IDH突变患者对放疗或烷化剂敏感 ②IDH突变患者预后相对较好 ③IDH突变患者提示低风险,并且预后优于IDH野生型胶质瘤患者 |
IDH2 | |
TERT | 诊断:①发生1p19q联合缺失的少突胶质细胞瘤总会伴有TERT突变 ②大部分胶质母细胞瘤,存在TERT突变 ③TERT突变,伴随IDH突变和1p19q联合缺失,提示为少突胶质细胞瘤 ④TERT野生型,伴随IDH突变,提示为星形细胞瘤 |
预后:IDH野生型的弥漫浸润性胶质瘤中,TERT突变型比野生型总生存降低 | |
BRAF | 用药和预后:BRAF V600E突变患者可能从维莫非尼的治疗中获益 |
技术参数
建库方法 | 多重PCR扩增技术 |
引物池 | 单管 |
基因/扩增子数目 | 4/36 |
检测区域 | 3.8kb |
检测类型 | SNV、short Indels |
平均扩增子长度 | ~145bp |
DNA起始量 | 20-60ng |
样本类型 | 组织 |
建库时间 | 低至8小时 |
测序平台 | Illumina、MGISEQ、Ion Torrent |