PiVAT® 生物信息学分析平台

PiVAT® 生物信息学分析平台

PiVAT®(The Pillar Variant Analysis Toolkit)是智能化生物信息分析软件系统,全Web界面,一步完成从测序原始数据(bcl或fastq)到突变列表的全部分析工作。 与基于SLIMamp的NGS检测互相补充,可得到精准可靠的突变分析结果。PiVAT软件包可以部署在云端或本地,而且使用标准的FASTQ文件格式处理数据。
通过局部比对或者从头合成序列拼接可以检测到较长的indels,同时抑制了因富集和分析方法产生的错误。
PiVAT提供一个标准的BAM(Binary Alignment Map)文件,同时也提供了一个PBAM的PiVAT版本。两者在标准生物信息流程中可以互换使用。

 



PiVAT




智能化生物信息分析系统
全web界面操作,一步完成从测序原始数据(bcl或fastq文件)到突变列表的全部分析工作。

PiVAT 生信分析流程基因组比对

PiVAT bioinformatics workflow aligns FASTQ file to the human genome, performs alignments, filtering and de novo assembly for accurate variant calling

PiVAT 通过减少测序错误为损坏的样品
提供了可靠的分析结果

使用肺癌结直肠癌基因检测Panel检测不同降解程度的FFPE标准品(Horizon Discovery)
评估突变检测的精确性(样本数:10)
Sequencing error reduction using Pillar PiVAT bioinformatics software
x轴:Onco/Reveal泛癌种靶序列25kb y轴:误差率
普通重现误差率(Q值≥20)用橙色表示
经PiVAT分析后较低的误差率用绿色表示

PiVAT生分信析软件携手ampPD引物设计平台和SLIMamp专利建库技术
提供目标区域靶向检测NGS全流程解决方案

ampPD™

icon of ampPD primer as located on DNA

独特的引物设计满足各类检测需求

SLIM amp®

test tube icon

二步法多重PCR实现单管高效文库构建

PiVAT®

PiVat icon

可视化分析软件提供灵敏、全面的突变检测