泛癌种RNA融合18基因检测Panel

本panel基于SLIMamp®专利技术基于RNA层面检测融合突变,参考权威指南和肿瘤数据库,选择18个融合驱动基因共164种融合形式,覆盖肺癌、甲状腺癌、前列腺癌等实体肿瘤。检测结果可用于:靶药指导、辅助诊断和分子分型

Panel 优势

检测肺癌、甲状腺癌和胰腺癌的常见融合突变

18个融合驱动基因共164种融合形式,以及MET 14外显子跳跃突变

基于RNA层面完成融合检测

既能检测组织和FFPE的RNA,也可以检测血液的cfRNA

基因列表

Target driver genesFusion partners
ALKEML4, CLTC, HIP1, KIF5B, KLC1, STRN, TFG, TPM3, TPR, MSN
RETCCDC6, CUX1, KIF5B, NCOA4, TRIM33, PRKARA1, NCOA4
ROS1CCDC6, CD74, CLTC, EZR, GOPC, LRIG3, MSN, SDC4, SLC34A2, TFG, TPM3
NRG1CD74, SLC3A2, VAMP2
PBX1TCF3
FGFR3TACC3, BAIAP2L1
FGFR2BICC1, CASP7
EGFRSPET14, PSPH, RAD51, EGFRVIII
NTRK1TPM3, TFG, LMNA, SQSTM1, CHTOP, ARHGEF2, NFASC, IRF2BP2, PPL, BCAN, SCYL3, TP53, CD74, MPRIP, TPR
NTRK2AFAP1, NACC2, BCR, TRIM24, QKI, PAN3, SQSTM1
NTRK3ETV6, BTBD1, EML4, SQSTM1, TFG, RBPMS
BRAFKIAA1549, MKRN1, FAM131B, AKAP9
RAF1ESRP1, SRGAP3
METKIF5B, Ex14 skipping
PPARGPAX8, CREB3L2
ERGTMPRSS2
PRKACADNAJB1
TFE3SFPQ, ASPSCR1, CLTC, PRCC, NONO

技术参数

                建库方法                多重PCR扩增技术
                引物池                单管
                基因/融合形式                18/164
                突变检测类型                RNA融合
                平均扩增子长度                120bp
                DNA起始量                10ng-50ng
                样本类型                提取自组织或FFPE样本的RNA
                建库时间                <9-10h
                测序平台                Illumina;  Ion Torrent and MGISEQ

性能验证

    出色的融合检测

    泛癌种RNA融合18基因检测Panel检测不同融合标准品的准确性验证

SeraSeq® Fusion v3
Fusion partnersDetected?
EML4-ALKYes
KIF5B-RETYes
NCOA4-RETYes
CD74-ROS1Yes
SLC34A-ROS1Yes
TPM3-NTRK1Yes
FGFR3-BAIAP2L1Yes
PAX8-PPARG1Yes
FGFR3-TACC3Yes
ETV6-NTRK3Yes
LMNA-NTRK1Yes
TMPRSS2-ERGYes
EGFR-SEPT14Yes
MET Exon 14 skippingYes
EGFR variant IIIYes
SeraSeq NTRK FFPE
Fusion partnersDetected?
TPM3-NTRK1Yes
LMNA-NTRK1Yes
IRF2BP2-NTRK1Yes
SQSTM1-NTRK1Yes
TFG-NTRK1Yes
AFAP1-NTRK2Yes
NACC2-NTRK2Yes
QKI-NTRK2Yes
TRIM24-NTRK2Yes
PAN3-NTRK2Yes
ETV6-NTRK3Yes
BTBD1-NTRK3Yes
Horizon™ 5 Fusion
Fusion partnersDetected?
EML4-ALKYes
CCDC6-RETYes
SLC34A-ROS1Yes
TPM3-NTRK1Yes
ETV6-NTRK3Yes

Pillar 技术

Pillar提供了从面板设计到数据分析的无缝集成NGS工作流程。

ampPD™

icon of ampPD primer as located on DNA

独特的引物设计满足各类检测需求

SLIM amp®

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二步法多重PCR实现单管高效文库构建

PiVAT®

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