黑色素瘤基因检测Panel
本panel基于SLIMamp®专利技术,用于筛查黑色素瘤(M)、胃肠间质瘤(G)、脑胶质瘤(G)相关49个基因的突变。
4个基因(SDHA-D)与胃肠间质瘤胚系突变有关,其他基因只检测体细胞突变。
设计检测23个基因的CNV,包括EGFRvIII。
Panel 优势
该产品可检测黑色素瘤、胃肠间质瘤和脑胶质瘤相关的常见基因
使用匹配的PiVAT分析软件完成数据分析,精准高效
建库时间短,仅需5小时即可完成文库构建,操作时间低至2小时
最低仅需20ng即可获得浓度和总量满足测序的文库
基因列表
AKT1 | ATRX | B2M | BAP1 | BCOR | BRAF | CCND1 |
CDK4 | CDK6 | CDKN2A | CDKN2B | CIC | CTNNB1 | DDX3X |
DICER1 | EGFR | ERBB4 | FOXL2 | GNA11 | GNAQ | H3F3A |
HRAS | IDH1 | IDH2 | JAK1 | JAK2 | KIT | KRAS |
MAP2K1 | MAP2K2 | MDM2 | MDM4 | MET | NF1 | NRAS |
PDGFRA | PIK3CA | PTEN | RB1 | SDHA | SDHB | SDHC |
SDHD | SF3B1 | SMARCB1 | STK11 | STK31 | TERT | TP53 |
技术参数
建库方法 | 多重PCR扩增技术 |
引物池 | 单管 |
基因/扩增子数目 | 49/840 |
检测区域 | 87kb |
检测类型 | SNV、short Indels、CNV |
平均扩增子长度 | ~132bp |
DNA起始量 | 20-60ng |
样本类型 | 组织、外周血(gDNA) |
比对率 | ~99.86% |
中靶率 | ~85.0% |
覆盖均一度(>0.2x) | ~94.0% |
建库时间 | 低至8小时 |
测序平台 | Illumina、MGISEQ、Ion Torrent |